ปัจจุบันส่วนหอสมุดกลาง มีฐานข้อมูล Online ซึ่งให้บริการอยู่บนเครือข่ายอินเทอร์เน็ต อยู่ ๒ ระบบ คือ ๑. Run อยู่บน Oracle Server คือ โปรแกรม VTLS ๒. Run อยู่บน Windows คือ โปรแกรม E-lib โปรแกรมทั้งสองตัวนี้ ได้รวบรวมและจัดเก็บฐานข้อมูลหนังสือทาง ด้านพระพุทธศาสนา งานวิจัย วิทยานิพนธ์ หนังสือทั่วไป และรวมถึงสื่อการเรียนการสอนอื่นๆ มากมาย ที่มีให้บริการภายในหอสมุดทั้งของส่วนกลาง วิทยาเขต วิทยาลัยสงฆ์ และห้องเรียน ในเครือข่ายของมหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัยทั่วประเทศไว้ให้บริการ ในการสืบค้นฐานข้อมูลของห้องสมุดแก่นิสิตนักศึกษา และบุคคลทั่วไปที่ต้องการศึกษาหาความรู้ด้านพระพุทธศาสนา ปัจจุบันในฐานข้อมูลมีหนังสือจำนวน ๑๑๗,๓๖๖ รายการ  ในการใช้งานโปรแกรมการสืบค้นทั้ง ๒ ฐานข้อมูลให้ศึกษาได้จากคู่มือตาม Linkนี้ ดาว์นโหลดคู่มือ